Balimall.id bekerjasama dengan Bank BPD Bali untuk penanganan pembayaran online melalui metode transfer, QRIS Statis, QRIS Dinamis, Virtual Account, dan Kartu Kredit Indonesia dengan proses integrasi langsung (host to host). Balimall.id juga bekerjasama dengan payment gateway DOKU untuk menangani pembayaran dengan kartu kredit dan bekerjasama dengan Bank BNI untuk menangani pembayaran dengan Virtual Account Static.
Balimall.id bekerjasama dengan raja ongkir dalam hal estimasi biaya dan layanan pengiriman dengan proses integrase langsung. Balimall.id juga bekerjasama dengan kurir lokal Detrans untuk pengiriman antar daerah lokal Bali.
Balimall.id bekerjasama dengan Lembaga Kebijakan Pengadaan Barang/ Jasa Pemerintah dengan menjadi salah satu e-merketpalce mitra Bela Pengadaan dan Toko Daring yang siap dengan mekanisme pengadaan pemerintah dengan sistem pasca bayar. Balimall.id juga bekerjasama dengan Pemerintah Provinsi dan Pemerintah Daerah untuk mensosialisasikan pemanfaatan e-marketplace untuk pengadaan Pemerintah.
balimall.id bekerjasama dengan beberapa fasilitator dan instasi Pemerintah yang membina UMKM/ IKM seperti Dinas Perindustrian dan Perdagangan, Dinas Koperasi, Dewan Kerajinan Nasional Daerah, Bank BPD Bali, Bank Indonesia, dan fasilitastor lainnya dalam hal pemberdayaan dan digitalisasi UMKM/ IKM, termasuk melaksanakan sosialisasi dan edukasi terhadap UMKM/ IKM dalam pemanfaatan e-marketplace untuk mendukung pengadaan Pemerintah.